我是四川大学华西药学院临床药学专业研二学生，我觉得就还选临床药学方向比较好。我本科也是临床药学，五年制的，所以医学知识学得还比较系统，也临床实习过一年，如果你是四年制的临药，只要在研一时多看些医学教材和文献就可以了，等到研二实习时不比五年制的差，我们院也有好多本科是四年制的同学。
向你推荐以下三所学校：四川大学华西药学院，北京大学医学部药学院，山东大学药学院。我们学校是全国最早开展临床药学教育的学校，附属医院也是首批全国临床药师试点，临床药学的研究生专业是独立招生，不像一般的学校是招在药剂学里面，而且专业课初试除了可以选择药学综合以外，也可以选择西医综合，研究生下临床实习很方便，也有搞基础研究的方向。北医的临床药学开展也较早，附属医院也是临床药师试点。山大有七年制的临药本硕连读专业，也单独招研究生，实力较强。不要报考南药与沈药的临床药学，它们不是医科大学，附属医院不行，出来只能搞些基础研究。临药专业较好的学校还有：复旦大学药学院，北京协和医学院药学院，浙江大学药学院，中南大学湘雅医学院药学院等。
北医协和都不好考，协和是医学的最高某考研品牌，挤进去很难，北医每年照的太少，因为他没有药学本科，都是本硕连读，所以单招很少，算上别的学校保送的，就很难进了。别的学校都差不多。
我考研时专业课选的是西医综合，因为学临药将来出来要做临床药师，必须有扎实的医学知识，所以你做好在本科阶段多补充一些医学知识，如果你想选药学综合，那么就要把化学学好，因为它就是考四大化学。
我也看了其他的回答，感觉也有一定道理，但是学药理更多的是做些基础研究，而学临药出来既可作基础也可做临床，就比如我们学院的临药教研室主任蒋学华老师，就是搞基础的。如果你将来能进临床药师试点的医院，那么是很有发展的。
药学考研学校排名：
1、北京协和医学院
2、中国药科大学
3、北京大学
4、沈阳药科大学
5、浙江大学
6、复旦大学
7、上海交通大学
8、山东大学
9、中山大学
10、四川大学
11、海军军医大学（第二军医大学）
12、首都医科大学
13、哈尔滨医科大学
14、华东理工大学
15、苏州大学
16、中国海洋大学
17、武汉大学
18、华中科技大学
19、中南大学
20、空军军医大学（第四军医大学）
21、南开大学
22、天津医科大学
23、中国医科大学
24、吉林大学
25、南京医科大学
26、浙江工业大学
27、安徽医科大学
28、郑州大学
29、广东药科大学
30、西安交通大学
31、南方医科大学
32、河北医科大学
33、辽宁中医药大学
34、延边大学
35、黑龙江中医药大学
36、南京中医药大学
37、温州医科大学
38、厦门大学
39、暨南大学
40、重庆医科大学
41、新疆医科大学
42、天津中医药大学
43、大连医科大学
44、南京工业大学
45、江南大学
46、江苏大学
47、徐州医科大学
48、浙江中医药大学
49、湖南中医药大学
50、广西医科大学
51、贵州医科大学
52、兰州大学
53、天津科技大学
54、山西医科大学
55、南昌大学
56、山东中医药大学
57、汕头大学
58、广州医科大学
59、成都中医药大学
60、遵义医学院
61、昆明医科大学
62、烟台大学
63、北京化工大学
64、同济大学
65、安徽中医药大学
66、济南大学
67、新乡医学院
68、湖北中医药大学
69、广州中医药大学
70、西南交通大学
71、青岛大学
72、成都大学